Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PRCDQ00LT1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PRCDQ00LT1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms