Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAT1AQ00266 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAT1AQ00266 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAT1AQ00266 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MAT1AQ00266 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MAT1AQ00266 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAT1AQ00266 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAT1AQ00266 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MAT1AQ00266 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MAT1AQ00266 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms