Protein–RNA interactions for Protein: P78545

ELF3, ETS-related transcription factor Elf-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF3P78545 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELF3P78545 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELF3P78545 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELF3P78545 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELF3P78545 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELF3P78545 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELF3P78545 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ELF3P78545 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ELF3P78545 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ELF3P78545 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ELF3P78545 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ELF3P78545 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms