Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AP1S1P61966 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms