Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UFM1P61960 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UFM1P61960 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UFM1P61960 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UFM1P61960 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UFM1P61960 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UFM1P61960 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UFM1P61960 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UFM1P61960 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UFM1P61960 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
UFM1P61960 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UFM1P61960 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
UFM1P61960 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms