Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms