Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms