Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA9P57773 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA9P57773 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA9P57773 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA9P57773 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA9P57773 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA9P57773 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA9P57773 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJA9P57773 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GJA9P57773 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GJA9P57773 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GJA9P57773 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJA9P57773 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJA9P57773 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJA9P57773 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms