Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB25P57735 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB25P57735 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB25P57735 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB25P57735 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB25P57735 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB25P57735 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB25P57735 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB25P57735 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB25P57735 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB25P57735 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB25P57735 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB25P57735 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB25P57735 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms