Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP7P55210 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP7P55210 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP7P55210 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP7P55210 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP7P55210 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP7P55210 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP7P55210 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP7P55210 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP7P55210 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP7P55210 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP7P55210 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP7P55210 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP7P55210 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms