Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HIRAP54198 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HIRAP54198 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIRAP54198 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIRAP54198 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HIRAP54198 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HIRAP54198 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HIRAP54198 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms