Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AP2S1P53680 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms