Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EFNA4P52798 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EFNA4P52798 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms