Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GSK3BP49841 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GSK3BP49841 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms