Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPIAP49247 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPIAP49247 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPIAP49247 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RPIAP49247 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms