Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6V1E1P36543 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6V1E1P36543 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms