Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJC1P36383 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJC1P36383 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJC1P36383 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJC1P36383 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GJC1P36383 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJC1P36383 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GJC1P36383 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
GJC1P36383 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GJC1P36383 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GJC1P36383 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GJC1P36383 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GJC1P36383 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GJC1P36383 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GJC1P36383 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GJC1P36383 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms