Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRS3P32247 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRS3P32247 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRS3P32247 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRS3P32247 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
BRS3P32247 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRS3P32247 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BRS3P32247 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BRS3P32247 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
BRS3P32247 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRS3P32247 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRS3P32247 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
BRS3P32247 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BRS3P32247 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms