Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXA6P31267 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms