Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDC27P30260 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDC27P30260 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDC27P30260 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC27P30260 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC27P30260 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC27P30260 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDC27P30260 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDC27P30260 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms