Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJB2P29033 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GJB2P29033 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GJB2P29033 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms