Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIFP27352 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIFP27352 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIFP27352 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIFP27352 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIFP27352 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIFP27352 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIFP27352 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GIFP27352 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GIFP27352 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GIFP27352 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GIFP27352 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms