Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMA1P25786 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms