Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GCSHP23434 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms