Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HRCP23327 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HRCP23327 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HRCP23327 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HRCP23327 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HRCP23327 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HRCP23327 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HRCP23327 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HRCP23327 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
HRCP23327 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HRCP23327 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HRCP23327 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HRCP23327 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HRCP23327 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms