Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HOXB9P17482 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms