Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
VPREB1P12018 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms