Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ESRRAP11474 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms