Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VSIG8P0DPA2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms