Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM225BP0DP42 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TMEM225BP0DP42 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms