Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MMP10P09238 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MMP10P09238 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMP10P09238 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MMP10P09238 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMP10P09238 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMP10P09238 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMP10P09238 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms