Protein–RNA interactions for Protein: P01880

IGHD, Immunoglobulin heavy constant delta, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHDP01880 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHDP01880 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHDP01880 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHDP01880 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHDP01880 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHDP01880 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IGHDP01880 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IGHDP01880 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IGHDP01880 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IGHDP01880 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IGHDP01880 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHDP01880 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHDP01880 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGHDP01880 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms