Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDX58O95786 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDX58O95786 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDX58O95786 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDX58O95786 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDX58O95786 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms