Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GMDSO60547 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GMDSO60547 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
GMDSO60547 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GMDSO60547 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GMDSO60547 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms