Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIN3BO60391 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIN3BO60391 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms