Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VEGFDO43915 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VEGFDO43915 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms