Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAB2O43741 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms