Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOCS1O15524 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms