Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
POLR1CO15160 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms