Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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