Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PATL2C9JE40 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms