Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LIPT2A6NK58 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms