Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRAMEF25A6NGN4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRAMEF25A6NGN4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms