Protein–RNA interactions for Protein: A4D126

ISPD, D-ribitol-5-phosphate cytidylyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISPDA4D126 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ISPDA4D126 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms