Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPDC1A2A3K4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPDC1A2A3K4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms