Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RAD54L2Q9Y4B4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAD54L2Q9Y4B4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAD54L2Q9Y4B4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAD54L2Q9Y4B4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RAD54L2Q9Y4B4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAD54L2Q9Y4B4 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAD54L2Q9Y4B4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAD54L2Q9Y4B4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAD54L2Q9Y4B4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAD54L2Q9Y4B4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAD54L2Q9Y4B4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAD54L2Q9Y4B4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms