Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF330Q9Y3S2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms