Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms