Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
USP20Q9Y2K6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
USP20Q9Y2K6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms