Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNX7Q9UNH6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms